Logiciel de facturation : lequel choisir avant septembre 2026

La moitié des comparatifs de logiciels de facturation publiés cette année affichent le mot « conforme » sans dire à quoi. C’est devenu un problème concret : depuis que la réforme de la facturation électronique a créé deux labels officiels aux noms voisins, un outil peut être parfaitement conforme et ne pas suffire à vous mettre en règle.

Cette page part de cette distinction, parce que c’est elle qui détermine si vous devrez ajouter un second abonnement en septembre.

Résumé rapide

• Deux labels officiels existent, un seul se suffit à lui-même. « Plateforme agréée » désigne un opérateur immatriculé par l’administration ; « solution compatible » désigne un logiciel qui doit se brancher sur une plateforme agréée.
• La conformité ne coûte rien. Abby, Indy et Tiime sont des plateformes agréées avec une offre de facturation gratuite. Payer n’achète pas la conformité, mais l’automatisation comptable.
• Le calendrier a deux dates. Recevoir des factures électroniques : 1er septembre 2026 pour tous. En émettre : 2026 pour les grandes entreprises et les ETI, 2027 pour les TPE, PME et micro-entreprises.
• Le bon critère de choix n’est pas la facturation — tous ces outils facturent correctement — mais ce qu’ils font autour : déclarations, synchronisation bancaire, lien avec l’expert-comptable.
• Choisissez Abby ou Indy en micro-entreprise, Pennylane en société avec un cabinet comptable, Qonto si le compte bancaire et la facturation doivent vivre au même endroit.

Quel logiciel selon votre situation

Votre situation	Outil conseillé	Pourquoi
Micro-entrepreneur, budget zéro	Abby (offre Basique)	facturation illimitée gratuite, estimation Urssaf, plateforme agréée
Indépendant au réel, BNC	Indy	comptabilité automatisée et déclarations fiscales intégrées
Société avec expert-comptable	Pennylane	conçu pour le travail à deux mains avec le cabinet
Compte bancaire et facturation unifiés	Qonto	facturation incluse dans le compte pro, IBAN français
Volume important, budget serré	Henrri	gratuit et illimité, mais solution compatible seulement
Test rapide sans engagement	Tiime	gratuit, sans expert-comptable partenaire imposé

La distinction qui change tout

L’administration fiscale a créé deux mentions, et Bpifrance Création prévient explicitement que d’autres labels circulent sans rapport avec la réforme.

« Plateforme agréée — Facturation électronique » identifie un opérateur immatriculé par l’État, autorisé à émettre, transmettre et recevoir des factures électroniques, et à extraire les données destinées à l’administration. Il fait le trajet complet.

« Solution compatible — Facturation électronique » identifie un logiciel qui produit des factures au bon format mais qui n’a pas d’immatriculation. Il doit se raccorder à une plateforme agréée pour que la facture parte réellement.

Un troisième détail mérite votre attention, et il est rarement mentionné : l’immatriculation existe en deux états. L’administration distingue l’immatriculation définitive, accordée « après réussite des tests d’interopérabilité en conditions réelles », de l’immatriculation sous réserve, accordée à un dossier complet mais encore en attente de ces tests. Un éditeur peut donc afficher le badge en toute bonne foi tout en n’ayant pas fini de prouver que sa plomberie fonctionne. La liste officielle est publiée par l’administration en deux tableaux séparés, précisément pour cette raison.

Concrètement : si votre logiciel est une solution compatible, vérifiez à quelle plateforme agréée il se raccorde et si ce raccordement est inclus dans votre prix.

Ce qu’il faut comparer avant de choisir

La facturation elle-même n’est plus un critère. Tous ces outils émettent un devis, le transforment en facture, numérotent correctement et gèrent les mentions légales. Les vraies différences sont ailleurs.

• Le statut vis-à-vis de la réforme, traité plus haut. C’est le seul critère éliminatoire.
• Ce qui se passe après la facture. Un logiciel de facturation pur s’arrête à l’envoi. Un outil de gestion enchaîne sur le livre des recettes, l’estimation des cotisations, la déclaration Urssaf, parfois la liasse fiscale. C’est là que se joue l’écart entre 0 € et 49 €.
• La compatibilité avec votre statut. Un outil pensé pour la micro-entreprise gère mal une SASU à l’impôt sur les sociétés, et réciproquement.
• La sortie. Pouvez-vous exporter l’intégralité de vos factures et de vos écritures si vous changez d’avis ? La question paraît théorique jusqu’au jour où votre expert-comptable réclame un format que l’outil ne produit pas.
• Le modèle économique du gratuit. Une facturation gratuite illimitée se paie ailleurs : commission sur encaissement, montée en gamme, ou compte bancaire associé.

Les logiciels de facturation à considérer

Abby — le gratuit le plus complet pour la micro-entreprise

Plateforme agréée. L’offre Basique est gratuite sans engagement et couvre les devis et factures illimités, le livre des recettes, le registre des achats, l’estimation des cotisations Urssaf et les alertes sur les seuils de TVA. Les offres payantes s’étagent ensuite : Start à 9 € HT par mois, Pro à 15 €, Business à 33 €, avec quatorze jours d’essai — des remises saisonnières abaissent régulièrement ces montants, vérifiez la page tarifs au moment de souscrire.

Pourquoi le choisir

• l’offre gratuite couvre réellement les obligations d’un micro-entrepreneur, pas seulement l’émission de factures ;
• les alertes de seuil évitent le franchissement involontaire de la franchise en base de TVA ;
• le produit est conçu pour un seul statut, ce qui se sent dans le vocabulaire de l’interface.

Limites

• inadapté si vous passez en société ou au régime réel : il faudra migrer ;
• la logique « tout dans Abby » suppose d’y tenir aussi sa gestion, pas seulement sa facturation.

Indy — la comptabilité automatisée des indépendants

Plateforme agréée immatriculée par la DGFiP. La structure tarifaire suit le statut : Essentiel à 0 €, Plus à 9 € HT par mois (108 €/an), puis un Premium dont le prix dépend du régime — 15 € en micro-entreprise, 22 à 49 € en entreprise individuelle selon le régime fiscal, 49 € pour une SAS, SASU, SARL ou EURL. La facturation illimitée et la synchronisation bancaire sont présentes à tous les niveaux ; c’est le Premium qui ajoute les déclarations obligatoires et leur télétransmission.

Pourquoi le choisir

• le seul de cette sélection qui automatise la déclaration fiscale jusqu’à l’envoi ;
• couvre BNC, sociétés, SCI et LMNP, donc vous suit si votre statut change ;
• l’offre gratuite permet de tester la synchronisation bancaire avant de payer.

Limites

• l’écart de prix entre Plus et Premium est franc, et c’est le Premium qui porte l’intérêt réel ;
• exclut certains régimes spécialisés, notamment l’agricole.

Pennylane — pour les sociétés qui travaillent avec un cabinet

Plateforme agréée. Les offres TPE vont de Starter à 7 € HT par mois à Premium à 79 €, en passant par Basique à 14 € et Essentiel à 24 €, avec une limite de 1 200 factures par an. La facturation électronique est incluse dans tous les plans sans supplément.

Pennylane n’est pas un cabinet comptable : c’est un logiciel conçu pour que vous et votre expert-comptable travailliez sur la même base. Si vous n’avez pas de cabinet, une grande partie de sa valeur reste inutilisée.

Pourquoi le choisir

• le plan Starter à 7 € est le point d’entrée le moins cher de cette sélection pour une société ;
• l’absence de surcoût pour la facturation électronique évite la mauvaise surprise de septembre ;
• c’est l’outil que beaucoup de cabinets connaissent déjà, ce qui raccourcit les échanges.

Limites

• surdimensionné pour un micro-entrepreneur seul ;
• le module comptable complet n’arrive qu’au plan Premium à 79 €.

Qonto — quand le compte et la facture ne font qu’un

Qonto se présente comme plateforme agréée, et la facturation est incluse dans l’ensemble de ses plans : Basic à 9 € HT par mois pour un indépendant, Smart à 19 €, Premium à 39 €, puis les offres équipe de 49 € à 199 €. Tous les plans incluent un IBAN français, une carte Mastercard physique et les virements SEPA, avec trente jours d’essai.

L’intérêt n’est pas la facturation prise isolément — d’autres la font aussi bien gratuitement — mais le fait que l’encaissement, le rapprochement et la relance vivent au même endroit.

Pourquoi le choisir

• supprime le rapprochement manuel entre facture émise et paiement reçu ;
• l’IBAN français évite les rejets de prélèvement encore fréquents avec certains IBAN étrangers ;
• l’attestation de dépôt de capital est délivrée rapidement lors d’une création de société.

Limites

• vous payez d’abord un compte bancaire, la facturation est un supplément fonctionnel ;
• changer de banque devient plus lourd quand toute la facturation y est logée.

Tiime — le gratuit sans conditions

Plateforme agréée. Tiime annonce une facturation gratuite pour les indépendants, sans carte bancaire, sans engagement et sans expert-comptable partenaire imposé — c’était historiquement la contrepartie de ce type d’offre, et son absence mérite d’être signalée. Des offres payantes existent au-delà.

Pourquoi le choisir

• l’entrée la plus rapide : compte créé, facture envoyée dans la foulée ;
• pas de dépendance à un cabinet partenaire.

Limites

• le périmètre gratuit sert d’entonnoir vers l’offre de compte professionnel ;
• moins riche qu’Abby sur le suivi des obligations propres à la micro-entreprise.

Henrri — gratuit, illimité, mais pas agréé

Henrri est le contre-exemple utile. Son offre Pro est gratuite sans limite de durée et couvre l’émission illimitée de factures de vente, y compris électroniques, ainsi que la réception de factures d’achat. Les offres payantes vont de 12 à 20 € par mois selon les fonctions.

Mais Henrri est une solution compatible, pas une plateforme agréée : la transmission passe par Pennylane, qui est agréée. Ce n’est pas un défaut de conformité, c’est une dépendance. Le modèle économique repose par ailleurs sur une commission d’encaissement de 1,2 % + 0,15 € par transaction.

Pourquoi le choisir

• gratuit et sans plafond, y compris pour un volume de facturation élevé ;
• le raccordement à une plateforme agréée est déjà en place, vous n’avez rien à monter.

Limites

• votre conformité dépend d’un partenariat entre deux éditeurs, pas d’un statut propre ;
• la commission d’encaissement peut dépasser le prix d’un abonnement si vous encaissez en ligne.

Quel choix selon votre profil

Vous démarrez en micro-entreprise

Prenez l’offre gratuite d’Abby, ou celle de Tiime si vous voulez le chemin le plus court. Vous êtes chez une plateforme agréée, vous ne payez rien, et vous tenez vos obligations. Repassez sur un plan payant le jour où l’estimation automatique des cotisations et le suivi des seuils vous font gagner plus d’une heure par mois. Pour situer vos seuils, notre page sur la TVA et le calcul HT/TTC donne les taux et le calculateur.

Vous êtes indépendant au régime réel

Indy Premium est le seul de cette liste à aller jusqu’à la télétransmission des déclarations. De 22 à 49 € par mois en entreprise individuelle selon le régime fiscal, et 49 € en société, il se compare au tarif d’un cabinet, pas à celui d’un logiciel de facturation. Le calcul est simple : si vous faites vos déclarations vous-même aujourd’hui, il vous fait gagner du temps ; si vous avez un expert-comptable, il fait doublon.

Vous dirigez une société avec un cabinet comptable

Demandez d’abord à votre cabinet ce qu’il utilise. Pennylane s’impose souvent parce qu’il est déjà en place de l’autre côté, et l’intérêt d’un outil partagé s’effondre si vous êtes le seul à l’utiliser. Le plan Starter à 7 € suffit pour commencer.

Vous facturez des grands comptes

Le sujet n’est plus le logiciel mais le portail de votre client. Vérifiez que votre outil sait produire le format qu’il exige et gérer les mentions de rattachement de commande. Et soyez prêt à recevoir des factures électroniques dès le 1er septembre 2026 : les grandes entreprises basculent en émission à cette date, ce sont donc vos fournisseurs et vos clients qui vous l’imposeront de fait.

Points de vigilance

Les prix sont hors taxes et souvent à l’engagement annuel. L’écart avec le montant prélevé mensuellement atteint couramment 30 %. Les remises promotionnelles affichées comme prix de référence brouillent encore la lecture : regardez le tarif de renouvellement.

Le gratuit illimité a une contrepartie. Commission sur les encaissements chez Henrri, entonnoir vers le compte professionnel chez Tiime, montée en gamme chez Abby. Aucune de ces contreparties n’est scandaleuse, mais elles rendent le coût réel dépendant de votre volume d’encaissement, pas de votre nombre de factures.

Un badge sur une page d’accueil ne vaut pas une immatriculation. Vérifiez le nom de l’éditeur dans la liste publiée par l’administration, et regardez s’il figure parmi les immatriculations définitives ou sous réserve.

Changer de logiciel en cours d’exercice se paie. Numérotation continue des factures, reprise de l’historique, formats d’export : c’est faisable, mais c’est une journée de travail. Autant choisir en fonction du statut que vous aurez dans deux ans, pas de celui d’aujourd’hui.

Voir aussi

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Verdict

La conformité à la réforme ne se paie pas : trois plateformes agréées de cette sélection facturent gratuitement. Ce que vous payez, c’est ce qui se passe après la facture — les cotisations estimées, les déclarations envoyées, le cabinet comptable qui lit les mêmes écritures que vous.

Recommandation courte : en micro-entreprise, commencez par l’offre gratuite d’Abby et n’en changez que le jour où votre statut change. En société avec un cabinet, alignez-vous sur Pennylane. Et si votre logiciel n’est qu’une solution compatible, vérifiez dès maintenant à quelle plateforme agréée il vous raccorde — c’est la vérification qui coûtera le plus cher à ceux qui l’auront reportée.